BioBlender to pakiet oprogramowania oparty na oprogramowaniu do modelowania 3D typu open source.Biologia działa w nanoskali, z obiektami niewidocznymi dla ludzkiego oka.Dzięki BioBlender można pokazać niektóre postacie, które zapełniają nasze komórki, w oparciu o dane naukowe i najwyższy standard manipulacji 3D.Naukowcy z całego świata badają białka na poziomie atomowym i przechowują informacje w publicznym repozytorium Protein Data Bank, gdzie każda cząsteczka jest opisana jako lista atomów i ich współrzędnych 3D .... Dzięki BioBlender użytkownicy mogą obsługiwać białka w przestrzeni 3D, pokazując ich powierzchnię w sposób fotorealistyczny i opracowując ruchy białek na podstawie znanych konformacji.Pliki PDB można ładować z katalogu zdefiniowanego przez użytkownika lub pobierać bezpośrednio z witryny PDB (wstawiając kod PDB).Białko jest wyświetlane w 3D (jako atomy lub powierzchnia molekularna), a użytkownik może obliczyć i wizualizować jego właściwości powierzchniowe, molekularny potencjał lipofilowy i potencjał elektrostatyczny.W przypadku ruchu białka BioBlender oblicza związki pośrednie między dwiema konformacjami za pomocą silnika gry Blender.Program podaje jako dane wyjściowe zarówno pośrednie pliki PDB, jak i renderowane obrazy jako filmy.BioBlender jest implementacją Blendera, otwartego, swobodnie dystrybuowanego, wieloplatformowego, interoperacyjnego i obsługiwanego programu do animacji 3D, efektów wizualnych i gier wideo.Połączenie grafiki komputerowej 3D, silnika gry i programów naukowych sprawia, że ​​BioBlender jest kompletnym narzędziem do opracowywania ruchu białek i wyświetlania ich powierzchni za pomocą kodu wizualnego opartego na teksturowaniu i efektach specjalnych cząstek.W ten sposób można pokazać właściwości fizyczne i chemiczne cząsteczki w ruchu.BioBlender jest wynikiem współpracy prowadzonej przez grupę SciVis w CNR w Pizie (Włochy) między naukowcami różnych dyscyplin (biologia, chemia, fizyka, informatyka) i