Clone Manager to komercyjny pakiet oprogramowania Sci-Ed do bioinformatyki, który wspiera biologów molekularnych w zarządzaniu danymi i umożliwia przeprowadzanie określonych analiz wstępnych in silico.Clone Manager zapewnia kompleksowy, w pełni zintegrowany zestaw narzędzi do operacji enzymatycznych, symulacji klonowania, rysowania mapy graficznej, projektowania i analizy starterów, globalnego i lokalnego dopasowywania sekwencji, wyszukiwania podobieństw i projektów składania sekwencji wielkości laboratoryjnej.